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[통계] 마이크로바이옴 분석시 그룹간 통계분석

## 연구자에게 있어서 통계분석은 절대적!으로 필요하다.최근에는 대부분의 프로그램 (R, Python 등) 은 사용자가 원하는 통계 분석을 쉽게 할 수 있도록 도와준다. 통계에 대한 깊이있는 지식이 없더라도 우리가 원하는 통계 결과를 도출할 수 있다.  분석하고자 하는 샘플에 따라 통계 방법이 달라지고 달라진 통계 방법에 따라 논문의 흐름과 방향이 달라진다. 이러한 이유 때문에 미루고 미뤄왔던 통계 공부를 시작해보려고 한다.   ## 두 그룹간 비교그룹 간 평균 비교는 마이크로바이옴 분석 시 (알파 다양성, 베타 다양성 등) 주로 사용된다. (특정 약물 또는 식품 섭취 전/후 비교 등)그룹 간의 비교를 하기 위해서는 크게 세 가지 조건을 부합해야 한다.  1. 결과값이 연속 변수인지    > Contin..

카테고리 없음 2024.11.21

Mendeley (멘델리) 사용 방법 (2)

## 오늘은 다양한 참고문헌 관리 도구 중 하나인 "Mendeley"를 실제로 사용하는 방법에 대한 리뷰를 해보려고 한다. 1. 논문을 찾아 멘델리에 업로드하는 방법2. 업로드된 논문을 워드 파일에 업로드하는 방법 이 두가지에 대해서 아주 쉽고 간단하게 알아보자.  첫 번째,논문을 찾아 멘델리에 업로드하는 방법! "거인의 어깨에 올라서서 더 넓은 세상을 바라보라 - 아이작 뉴턴"연구자라면 한 번쯤 두근 거리는 이 글귀를 본 적이 있을 것이다.  구글 학술 검색(https://scholar.google.co.kr/)으로 들어가서 내가 찾고자 하는 논문을 검색한다. 그리고 저번에 설치했던 크롬 확장 프로그램에 설치한 mendeley 버튼을 클릭해준다.  그럼 내가 찾고자 했던 논문이 보인다.  내가 만들어둔..

카테고리 없음 2024.11.21

Mendeley (멘델리) 사용 방법 (1)

## 오늘은 다양한 참고문헌 관리 도구 중 하나인 "Mendeley" 사용방법에 대한 리뷰를 해보려고 한다.한 분야에 대해 다양한 논문들을 읽을 때, 혹은 논문을 작성할 때 사용할 수 있는 유용한 "툴"이다.  다양한 기존에는 Endnote를 사용하였지만, 디바이스 간 호환성이 굉장히 낮아 불편함을 느끼는 도중교수님의 권유로 "Mendeley"를 설치해서 사용해보았다.  Mendeley의 가장 큰 장점!!바로 "애플의 생태계 (The Apple Ecosystem)"와 같이 클라우드 형식으로 논문을 저장할 수 있어서, 언제 어디서든 논문 작업이 가능하다.  그래서 지금 작업하고 있는 논문까지만 Endnote를 사용하고, 다음 논문은 Mendeley로 작업을 해볼 예정이다.  이번엔 Mendeley 설치법에..

카테고리 없음 2024.11.21

프롤로그

#1 4년간의 회사 생활저는 15년도에 대학을 졸업하고 그해 프로바이오틱스 회사를 들어갔습니다. 그 당시에는 “돈을 벌자!” 라는 목표를 가지고 막연히 내 전공을 살릴 수 있는 회사를 선택했던 것 같습니다. 학부때 배운 전공 지식이 전부인 저는 회사에서 다양한 실험들을 접할 기회가 있었습니다. 회사가 성장하면서 나도 함께 성장하였지만.. 한가지 고민거리가 있었습니다. 회사가 성장하면서 새로운 인재들을 영입하게 되는데 ‘석사, 박사’ 연구원들이 들어오게 됩니다. 차근 차근히 쌓아올린 경력보다는 그들의 학위가 더 큰 힘을 발휘할때마다 부담을 많이 느꼈습니다. 10년, 20년 후의 나도 항상 제자리일것만 같은 불안감이 엄습했습니다. 그래서 저는 큰 고민 끝에 대학원 진학을 고민하게 됩니다. #2 파트석사로 시..

카테고리 없음 2024.11.20

15. 하루 식단으로 마이크로바이옴을 강화하는 방법

하루 식단으로 마이크로바이옴을 강화하는 방법아침: 유산균 요거트와 과일아침 식사는 프로바이오틱스가 풍부한 요거트와 섬유질이 많은 과일(바나나, 블루베리)로 시작하세요. 이는 장내 유익균을 활성화하고 소화를 돕습니다.점심: 채소와 통곡물 위주의 식사점심에는 퀴노아 샐러드나 현미밥과 같은 통곡물, 브로콜리, 당근 등의 채소를 곁들인 식단을 추천합니다. 이러한 음식은 유익균의 먹이가 되는 섬유질을 풍부하게 제공합니다.저녁: 저염 발효식품과 단백질저녁에는 된장국이나 김치와 같은 발효식품과 닭가슴살, 생선과 같은 고단백 음식을 조합하세요. 발효식품은 유익균을 공급하고, 단백질은 장 점막을 강화합니다.간식과 음료간식으로 견과류와 콤부차를 섭취하세요. 콤부차는 발효 음료로 장내 환경을 최적화하며, 견과류는 단백질과 ..

카테고리 없음 2024.11.20

14. 장내 환경을 해치는 나쁜 습관과 이를 개선하는 방법

장내 환경을 해치는 나쁜 습관과 이를 개선하는 방법장 건강을 해치는 나쁜 습관과도한 가공식품 섭취: 고당분, 고지방 가공식품은 유익균을 감소시키고 유해균을 증가시킵니다.불규칙한 식사 시간: 식사 시간이 일정하지 않으면 장내 리듬이 깨져 미생물 군집에 악영향을 미칩니다.항생제 남용: 항생제는 유익균과 유해균을 모두 제거하여 장내 환경을 손상시킬 수 있습니다.스트레스: 만성 스트레스는 코르티솔 분비를 증가시켜 장내 미생물 다양성을 저하시킵니다.건강한 장을 위한 개선 방법자연식 섭취: 가공식품 대신 채소, 과일, 통곡물 같은 자연식을 선택하세요.규칙적인 식사: 일정한 시간에 식사를 하면 장내 리듬이 안정됩니다.프로바이오틱스 보충: 발효식품이나 보충제를 통해 유익균을 꾸준히 섭취하세요.운동과 명상: 신체 활동과..

카테고리 없음 2024.11.20

13. 특정 질환(당뇨, 비만)과 마이크로바이옴의 관계

특정 질환(당뇨, 비만)과 마이크로바이옴의 관계당뇨와 마이크로바이옴의 관계장내 마이크로바이옴은 혈당 조절에 중요한 역할을 합니다. 연구에 따르면, 2형 당뇨 환자의 장내 유익균은 감소하고 염증을 유발하는 유해균이 증가한 상태입니다. 특히 단쇄 지방산(SCFAs)을 생성하는 균의 부족은 인슐린 저항성을 악화시킬 수 있습니다.비만과 마이크로바이옴의 연관성비만 환자의 장내에는 **퍼미큐테스(Firmicutes)**와 **박테로이데테스(Bacteroidetes)**의 비율이 정상보다 높게 나타납니다. 이는 열량 추출 효율이 증가하여 체중 증가로 이어질 수 있습니다. 장내 환경의 변화는 지방 축적과 염증 유발을 통해 비만을 악화시킵니다.질환 개선을 위한 마이크로바이옴 관리법발효식품 섭취: 요거트, 김치 등은 유익..

카테고리 없음 2024.11.20

12. 설탕과 장 건강: 마이크로바이옴에 미치는 영향

설탕과 장 건강: 마이크로바이옴에 미치는 영향설탕이 장내 환경에 미치는 부정적 효과설탕은 장내 유익균을 억제하고 유해균의 증식을 촉진하는 원인이 됩니다. 특히 과도한 설탕 섭취는 염증 반응을 유발하고, 유익균의 먹이인 섬유질 섭취를 줄이는 부작용을 초래합니다.설탕 대체 식품 추천스테비아: 천연 감미료로 혈당을 급격히 올리지 않고 단맛을 제공합니다.꿀: 소량 사용 시 유익균 증식을 돕는 효소와 항산화 물질을 제공합니다.메이플 시럽: 천연 감미료로 가공 설탕보다 장내 환경에 긍정적입니다.건강한 식단을 위한 팁설탕 섭취를 줄이고 자연식품 위주의 식단을 구성하세요. 채소와 과일을 기반으로 한 식단은 장 건강을 유지하고 유익균을 활성화하는 데 도움을 줍니다.설탕을 줄이는 작은 실천이 건강한 장내 환경을 만듭니다...

카테고리 없음 2024.11.20

11. 마이크로바이옴이 소화 건강에 중요한 이유

마이크로바이옴이 소화 건강에 중요한 이유마이크로바이옴과 소화 과정장내 미생물은 음식물의 분해와 영양소 흡수에 핵심적인 역할을 합니다. 특히 식이섬유를 발효하여 단쇄 지방산(SCFAs)을 생산하며, 이는 장 점막을 보호하고 소화를 촉진합니다.소화기 질환과 마이크로바이옴의 상관관계장내 유익균의 부족은 과민성 대장 증후군(IBS), 크론병, 궤양성 대장염 등 소화기 질환의 주요 원인으로 지목되고 있습니다. 유해균이 증가하면 염증 반응이 활성화되고 장 점막이 손상될 가능성이 높아집니다.소화 건강을 위한 실천 방법수분 섭취: 충분한 수분은 소화를 원활하게 하고 변비를 예방합니다.발효식품과 식이섬유 섭취: 유익균의 성장을 돕는 발효식품과 식이섬유가 풍부한 음식을 섭취하세요.가공식품 제한: 장내 환경을 악화시키는 가..

카테고리 없음 2024.11.20